O 12:18 hod. Teroristická bomba exploduje v parkovacej garáži Svetového obchodného centra v New Yorku, pričom necháva kráter široký 60 stôp a spôsobuje kolaps niekoľkých železobetónových podláh v blízkosti výbuchu. Hoci teroristická bomba kriticky nepoškodila hlavnú štruktúru mrakodrapov, šesť ľudí bolo zabitých a viac ako 1 000 bolo zranených. Samotné Svetové obchodné centrum utrpelo viac ako 500 miliónov dolárov škody. Po útoku úrady evakuovali 50 000 ľudí z budov, z ktorých stovky trpeli inhaláciou dymu. Evakuácia trvala celé popoludnie.
Mestské úrady a Federálny úrad pre vyšetrovanie (FBI) podnikli rozsiahle pátranie po podozrivých a počas niekoľkých dní bolo zatknutých niekoľko radikálnych islamských fundamentalistov. V marci 1994 boli federálnou porotou odsúdené Mohammed Salameh, Ahmad Ajaj, Nidal Ayyad a Mahmoud Abouhalima za ich úlohu pri bombardovaní a každá z nich bola odsúdená na doživotie. Palestínčan Salameh bol zatknutý, keď išiel získať zálohu 400 dolárov, ktorú zanechal pre nájomnú loď Ryder použitú pri útoku. Ajaj a Ayyad, ktorí zohrali úlohu pri stavbe bomby, boli čoskoro potom zatknutí. Abouhalima, ktorý pomáhal kupovať a miešať výbušniny, utiekol do Saudskej Arábie, ale o dva týždne neskôr ho chytili v Egypte.
Hlavný predstaviteľ útoku Ramzi Ahmed Yousef zostal na slobode až do februára 1995, keď bol uväznený v Pakistane. Predtým bol na Filipínach av počítači, ktorý opustil, boli nájdené teroristické plány, ktoré obsahovali sprisahanie zabitia pápeža Jána Pavla II. A plán bombardovania 15 amerických lietadiel za 48 hodín. Počas letu späť do Spojených štátov Yousef údajne priznal agentovi tajnej služby, že od začiatku nasmeroval útok na obchodné centrum a dokonca tvrdil, že dal poistku, ktorá vybuchla bombu s hmotnosťou 1 200 libier. Podľa agenta Jousefa ľutuje iba to, že 110-poschodová veža nespadla do dvojča ako plánovaná katastrofa, ktorá by spôsobila tisíce úmrtí.
Eyad Ismoil, ktorý odviezol dodávku Ryder do parkovacej garáže pod Svetovým obchodným centrom, bol toho roku zajatý v Jordánsku a odvezený späť do New Yorku. Všetci zapojení muži mali väzby na šejka Omara Abdel Rahmana, radikálneho egyptského náboženského vodcu, ktorý pôsobil mimo Jersey City v New Jersey, ktorý sa nachádza hneď za riekou Hudson od Manhattanu. V roku 1995 boli Rahman a 10 stúpencov odsúdení za sprisahanie, že vyhodia do povetria sídlo Organizácie Spojených národov a ďalšie newyorské pamiatky. Prokurátori tvrdili, že útok Svetového obchodného centra bol súčasťou tohto sprisahania, hoci bol predložený jasný dôkaz o tomto obvinení.
V novembri 1997 boli Yousef a Ismoil odsúdení v súdnej sieni len pár blokov od dvojičiek a následne boli odsúdení na doživotie bez možnosti podmienečného prepustenia. Iba jeden ďalší muž, o ktorom sa verí, že sa na útoku priamo zúčastnil, zostáva iracký Abdul Rahman Yasin.
Po bombových útokoch na americké veľvyslanectvá v Keni a Tanzánii v roku 1998 začali americkí vyšetrovatelia podozrenie, že Yousef mal väzby so saudskoarabským emigrantom Usámom bin Ládinom, šéfom anti-U.S. teroristická sieť al-Káidy. To, či sa bin Ládin skutočne zúčastnil útokov na Twin Tower v roku 1993, nebolo stanovené, ale 11. septembra 2019 dve skupiny teroristov z al-Káidy dokončili prácu, ktorú začal Jousef, a narazili na dve unesené dopravné lietadlá na severnú a južnú vežu Svetové obchodné centrum.
Konštrukčná oceľ mrakodrapov nemohla odolať ohromnému teplu generovanému spaľovacím prúdovým palivom a obe sa zrútili do dvoch hodín od zásahu. Vo Svetovom obchodnom centre a jeho okolí zahynulo takmer 3 000 ľudí, vrátane ohromujúcich 343 hasičov a 23 policajtov, ktorí sa snažili dokončiť evakuáciu a zachrániť administratívnych pracovníkov uväznených na vyšších poschodiach. V čase ich kolapsu prežilo iba šesť ľudí v budovách Svetového obchodného centra. Takmer 10 000 ďalších ľudí bolo liečených na zranenia, mnohí boli závažní.
